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Ich hab das mal skizziert:
2 Transistoren: Einer kommt auf den Mikrocontrollerausgang der ein 38kHz Signal erzeugt.
Der andere wird an den Mikrocontrollerausgang gehängt der dir dein Signal erzeugt, also z.B. Impule mit der Dauer von 1ms.
Da nur dann Strom durch die Diode fließt wenn beide Transisotren geschaltet sind hast du auf der LED dann dein aufmoduliertes Signal.
Basiswiderstände(zwischen µC und Transistorbasis) nicht vergessen; z.B. 1kOhm.
Kennst du Asuro? Dort wird mit IR gearbeitet, dort könntest du dirs ja mal anschauen, die Schaltpläne sind frei im Netz verfügbar.