ein ähnliches Problem wie dein beschriebenes wird auch für die Fischertechnik-Controller TX und TXT berichtet:
Der alte TX (200 MHz ARM9: langsamerer Takt, aber OHNE Linux)
ist bei timer-getriggerten Tests schneller als der
neue TXT (600MHz ARM Cortex A8 + Cortex M3: höherer cpu-Takt, sogar mit ARM Coprozessor, aber MIT Linux) !
Exakt wie ich es auch für Arduino vs. Raspi beschrieben habe!
http://forum.ftcommunity.de/viewtopi...p=22998#p22998
Linux ist eben das Gegenteil von Echtzeit-fähig.