ob du die interne oder die externe als AREF verwendest ist nebensächlich
nur die am ADC pin angelegte spannung darf halt nur zwischen GND und AREF liegen

An deiner stelle würde ich mich noch mal gründlich über die Funktionsweise des ADCs im Atmega32 informieren.
Das könnte dir dabei helfen:
http://www.mikrocontroller.net/artic...l_Converter.29