Nur zum Bremsen und vorwärts drehen braucht man keine ganze H- Brücke. Es reicht eine Halbbrücke, also mit nur 2 MOSFETs als Schaltelement. Das reduziert die Verluste schon mal auf die Hälfte.

Bei der Spannung muss man berücksichtigen, dass die Akkus im vollen mehr als die nominalen 1,2 V je Zelle haben. Die Schaltung sollte auch mit 1,4 V je Zellen, also 42 V klar kommen.

3600 RPM sind eigentlich noch nicht besonders viel für einen DC Motor. Ein Problem ist aber das bei größeren Motoren der Wirkungsgrad meist relativ hoch ist, und entsprechend der Innenwiderstand relativ klein. Dadurch wird der Strom beim Bremsen per Kurzschluss einfach zu hoch. Wenn es nur um langsamer Bremsen geht, tut es da ggf. auch ein Widerstand im Bremskreis.