motorstromüberwachung

hi,
ich habe ein kleines problem mit der motorstromüberwachung.
bisher lese ich über einen ad port die shuntspannung aus und bilde den mittelwert. ganz simple eigentlich. jetzt hab ich nur ein problem mit der weiterverarbeitung dieser daten. ich weiss nicht ob ich den anlaufstrom der motoren bei der überwachung beachten muss und wie ich das ganz in c umsetzten soll. bisher wird bei bei gemessen 1A die pwm für die ansteuerung der motoren reduziert.
hat jemand ne idee oder ein bespiel für mich ?