Hallo,
da gibt es schon eine mitgelieferte Lösung. Schau dir mal Firmata an. Auf deren Seite: http://firmata.org/wiki/Main_Page gibt es ein Beispiel in C++.
Also Firmata aus der Arduino IDE flashen und das Beispiel Programm auf den PC und du kannst die I/Os schalten.
Gruß Ingo
PS: auf meiner Webseite gibt es auch ein kleines Beispiel in Java