soll ich dann das makefile von winavr da reinkopieren oder wie?
Am besten, du nimmst ein makefile von einem der Beispielprograme des RP6.
Normalerweise fängt man ja so an, dass man ein Beispiel (z.B. Example_01_LEDs) hernimmt und das dann ändern will oder auf der Basis dieses Programms weiter machen will. Dann kopiert man einfach das ganze Verzeichnis Example_01_LEDs und fügt es unter neuem Namen (meinetwegen Example_09_LEDsNew) im Verzeichnis RP6BASE_EXAMPLES wieder ein. Dann hat man auch gleich ein passendes makefile.
Die Meldung *** No rule to make target `all' gibt es meist, wenn im Eintrag TARGET = im makefile kein passendes Programm (z.B. MyProg.c) eingetragen ist: TARGET = MyProg

Gruß Dirk