Kommt der verlust aufgrund des Transistors?
Nein, das ist ein zu hoher Spannungsverlust. Zeig mal, wie du den Transistor beschaltet hast.

Ich könnte doch auch einfach 4 Stück in Reihe schalten und die dann mithilfe eines 9V Spannungsreglers auf 9V Stabilisieren damit ich nicht ständig die Batterie wechseln muss.
Nein, nicht in Reihe, sondern parallel. Dabei addiert sich die Kapazität. Alle Batterien müssen dann aber immer gleich frisch sein.
Besser: Ein Batteriehalter z.B. für 6 Mignon- oder Baby-Zellen in Reihe. Die haben dann auch 9V, aber eine viel längere Haltbarkeit als die Blocks.