Ich kenne keinen USB-ISP-Programmer der diese Funktion hat. Diese gab es nur bei den alten Dongle die am Parallelport angeschlossen waren.
Es ist sicher keine Eigenheit des Mega128.
Wenn du in deinem Programmer den Pin3 des Stecker verfolgst wirst du sehen das dieser leer ist.
Leg mal GND auf diesen Pin und du wirst sehen, es funktioniert.